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新藥浪潮之寡核苷酸藥物(下)
發(fā)布時(shí)間:2023-09-13 文章來(lái)源:本站

       寡核苷酸藥物是人工合成的具有10~30個(gè)核苷酸組成的單鏈或雙鏈RNA或DNA藥物,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)作用于mRNA或其前體pre-mRNA并阻斷其表達(dá),從而抑制蛋白質(zhì)生成,目前已有上百個(gè)臨床項(xiàng)目在世界范圍內(nèi)開展[1],主要用于治療罕見、疑難疾病,如癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、心血管疾病、乙型肝炎等。寡核苷酸藥物具有特異性強(qiáng)、基因靶點(diǎn)豐富、療效持久等特點(diǎn),有望成為繼小分子藥物和抗體藥物之后的第三代藥物。

       與小分子藥物和抗體藥物以蛋白質(zhì)為靶標(biāo)不同,科學(xué)家基于中心法則,針對(duì)“致病蛋白”為不可成藥靶標(biāo)的情況,通過(guò)干擾“致病蛋白”的生成,開發(fā)了以反義寡核苷酸(Antisense oligonucleotide, ASO),小干擾RNA (small interfering RNA, siRNA),微小RNA (micro-RNA, miRNA)和核酸配體(Aptamer)等為代表的寡核苷酸藥物,旨在通過(guò)干擾靶基因的轉(zhuǎn)錄、翻譯過(guò)程以控制靶標(biāo)蛋白的生成,從而治療疾病。

圖1 中心法則”三步曲”(圖片來(lái)自于網(wǎng)絡(luò))

        為了便于廣大同仁更全面的了解該類新藥,本文重點(diǎn)從寡核苷酸藥物的獲批情況、作用機(jī)制、結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、藥理學(xué)、成藥性等方面展開討論,擬在充分了解這些信息的基礎(chǔ)上為臨床前及臨床評(píng)價(jià)策略的制定提供科學(xué)、全面、有效的數(shù)據(jù)與理論支持,以期推動(dòng)人類大健康產(chǎn)業(yè)的高質(zhì)量穩(wěn)步快速發(fā)展。

上篇鏈接:新藥浪潮之寡核苷酸藥物(上)

 

  • 化學(xué)修飾和遞送系統(tǒng)

       寡核苷酸藥物成藥性的實(shí)現(xiàn)主要克服了包括但不限于藥物穩(wěn)定性(未受保護(hù)的ASO在約30分鐘內(nèi)被血漿中的3'至5'核酸外切酶降解,而細(xì)胞內(nèi)核酸酶在<10分鐘內(nèi)將其分解)、穿過(guò)細(xì)胞膜到達(dá)靶標(biāo)(寡核苷酸分子帶負(fù)電荷、親水性,血漿蛋白結(jié)合率低,易被腎臟快速過(guò)濾并在尿液中排出,且難通過(guò)細(xì)胞膜的脂質(zhì)雙分子層)、防止脫靶(對(duì)靶標(biāo)親和力差)等問題,藥物結(jié)構(gòu)方面在優(yōu)化序列設(shè)計(jì)的基礎(chǔ)上,著重進(jìn)行了化學(xué)修飾和選用遞送系統(tǒng)等方面的改進(jìn)。

  • 化學(xué)修飾

       對(duì)于寡核苷酸分子結(jié)構(gòu)的修飾,主要從其三個(gè)官能團(tuán)磷酸骨架、糖和堿基著手考慮,從以下方面來(lái)提高藥理藥效:一是提高藥物對(duì)核酸酶的抗性;二是增加與靶向mRNA的結(jié)合力;三是調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合率,使其在不被快速清除的前提下穿過(guò)細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞發(fā)揮藥理作用;四是降低免疫原性;五是降低毒性。至今,寡核苷酸藥物修飾已經(jīng)從第一代發(fā)展到第三代[2],詳見表4(根據(jù)E. Doxakis. Med Res Rev., 2020: 1–33整理)。

表4 ASO藥物化學(xué)修飾

代序

修飾方式

優(yōu)點(diǎn)

待改進(jìn)方面

第一代

硫代磷酸(PS)主鏈:通過(guò)用硫(S)原子取代磷酸基團(tuán)中的一個(gè)非橋接氧原子來(lái)制備的

  • 提高了抗核酸酶降解能力;
  • 增加了血漿蛋白(如白蛋白)結(jié)合率,降低了ASO的腎臟清除率并增加了滯留率,從而實(shí)現(xiàn)了更廣泛的生物分布;
  • 硫骨架負(fù)電荷密度增加,提高了體外和體內(nèi)ASO的細(xì)胞攝?。?/li>
  • 保留了募集RNase H1酶能力,允許靶RNA的切割和降解。
  • 由于干擾正常蛋白質(zhì)功能和激活補(bǔ)體系統(tǒng),增加了毒性和免疫原性的風(fēng)險(xiǎn);
  • 手性控制并提高藥效;
  • 形成弱雙工器。

N3'-磷酸酰胺:3'OH基團(tuán)被胺取代。

與PS相比

  • 這種主鏈結(jié)構(gòu)賦予核酸酶抗性并增加結(jié)合親和力;
  • 蛋白結(jié)合率低。
  • 消除了RNase H1活性。

硼磷酸

 

幾乎不用于增強(qiáng)RNase H1 核酸酶穩(wěn)定性的修飾。

第二代

2'-O-甲基(2'-OMe)

  • 增加了對(duì)核酸酶的抗性;
  • 提高了雜交親和力;
  • 減少了非特異性蛋白質(zhì)結(jié)合;
  • 降低了毒性。
 

阻礙RNase H1酶切割靶RNA

2'-O-甲氧基乙基(2'-MOE)

 

鎖定核酸(LNA):4‘碳通過(guò)亞甲基橋連接到2’羥基

  • 增加了核酸酶抗性;
  • 優(yōu)越的雜交親和力。

有毒性

2'-氟(2'-F)

與2'-OMe相比,

  • 增加了核酸酶抗性;
  • 更好的結(jié)合親和力。
 

S-限制-乙基(cEt)橋接核酸(BNA)(cEt-BNA)

將2'-MOE和LNA的結(jié)合,

  • 與LNA具有相似結(jié)合親和力;
  • 增加了核酸酶抗性;
  • 不良毒性作用較小。
 

三環(huán)脫氧核糖核酸(tc‐DNA)

  • Tc-DNA對(duì)DNA和RNA都表現(xiàn)出穩(wěn)定的Watson–Crick和Hoogsteen以及反向Hoogsteen堿基配對(duì);
  • 表現(xiàn)出比2'-OMe和LNA寡核苷酸更強(qiáng)的選擇性、熱穩(wěn)定性和效率。
 

第三代

磷酸二酰胺嗎啉(PMO):具有取代呋喃糖環(huán)的嗎啉環(huán)和取代帶負(fù)電荷磷酸二酯酶骨架的中性磷酸二酰胺骨架

  • 不被核酸酶降解;
  • 顯示出高結(jié)合親和力;
  • 不觸發(fā)RNase H1活性;
  • 顯著降低了毒性。

血漿蛋白結(jié)合率低,易被腎臟迅速清除,因此,需要更高的劑量,或與肽結(jié)合以提高細(xì)胞攝取。

肽核酸(PNA):有一個(gè)由N-(2-氨基乙基)甘氨酸組成的肽骨架,取代了糖磷酸鹽骨架。

盡管與核酸的正常結(jié)構(gòu)存在很大差異,

  • PNA也在利用Watson–Crick、Hoogsteen和反向Hoogsteen堿基配對(duì)進(jìn)行RNA甚至DNA結(jié)合;
  • 對(duì)核酸酶和蛋白酶具有抗性;
  • 具有更高的結(jié)合親和力。
  • 由于其陽(yáng)離子性質(zhì),在水中的溶解性較差,但添加到C末端肽中的賴氨酸增加了其溶解度和吸收;
  • 從外周給藥時(shí)會(huì)迅速?gòu)哪I臟中清除,但可以通過(guò)構(gòu)建不同的細(xì)胞穿透肽(CPPs)來(lái)補(bǔ)救;
  • 不能激活RNase H1

其他對(duì)糖的修飾

無(wú)水乙醇核酸(HNAs):由磷酸化的2,3-二脫氧-D-阿拉伯糖醇單元組成

  • 與互補(bǔ)的DNA和RNA寡核苷酸形成穩(wěn)定的雙鏈體;
  • 對(duì)3'-單核酶表現(xiàn)出完全耐受性。
  • 消除了RNase H1的活性。

環(huán)己烯核酸(CeNAs):呋喃糖部分被環(huán)己烯環(huán)取代

  • 與RNA形成雙鏈體,該雙鏈體比DNA-RNA雙鏈體更穩(wěn)定;
  • 在血清中具有核酸酶抗性;
  • 可以誘導(dǎo)RNase H1活性。
 

D-阿糖醇核酸(ANAs):,由磷酸化的D-阿糖醇骨架組成

核堿基插入碳水化合物部分的2'-位。它在結(jié)構(gòu)上與HNA的不同之處在于在3'-α-位存在一個(gè)補(bǔ)充羥基,這意味著阿糖醇部分的3'碳采用(S)-構(gòu)型,

  • 對(duì)采用類似于天然RNA的A型雙鏈結(jié)構(gòu)的互補(bǔ)RNA和DNA核苷酸具有很高的雜交親和力;
  • 在人類血清中非常穩(wěn)定。

經(jīng)測(cè)試,與單獨(dú)的2'-OMe寡核苷酸相比,其活性或穩(wěn)定性沒有任何顯著改善。

其他對(duì)堿基的修飾

胞嘧啶(C)第5位的甲基

  • 熱穩(wěn)定性提高;
  • 降低了免疫刺激特性;
  • 降低了核酸酶穩(wěn)定性。
 

胞嘧啶(C)第5位的5-丙炔基C

  • 比5-甲基C進(jìn)一步提高了結(jié)合親和力。
 

2,6二氨基嘌呤修飾

  • 熱穩(wěn)定性提高
 

2-硫代T修飾

  • 通過(guò)靶向SNPs來(lái)調(diào)節(jié)ASOs的等位基因選擇性;
  • 在gapmer區(qū)域特定位置的引入被證明改變了RNase H1活性。
 

圖5 ASO藥物中應(yīng)用的化學(xué)修飾(E. Doxakis. Med Res Rev., 2020: 1–33)

  • 遞送系統(tǒng)

       寡核苷酸藥物到達(dá)靶位需要進(jìn)入靶細(xì)胞,除了可以通過(guò)化學(xué)修飾改變其與細(xì)胞表面蛋白的結(jié)合,以內(nèi)吞的形式到達(dá)靶位發(fā)揮藥效外,還可以通過(guò)遞送系統(tǒng)將被天然或合成載體包裹或結(jié)合的寡核苷酸藥物傳遞到特定組織中的靶細(xì)胞,以免于被降解、巨噬細(xì)胞吞噬等。這些載體包括病毒和非病毒載體。病毒載體由于其安全性、成藥性和成本等原因限制了其臨床應(yīng)用。而非病毒載體由于其低毒、納米尺寸和多功能性優(yōu)勢(shì)等已經(jīng)被應(yīng)用于siRNA藥物中。五款已上市siRNA藥物中,一款使用脂質(zhì)納米粒(LNP),四款使用N-乙酸半乳糖胺(GalNAc)綴合物進(jìn)行遞送,五款藥物均為靶向肝細(xì)胞的遞送系統(tǒng)。

       與小分子藥物的LNP劑型只需要在到達(dá)靶組織后釋放負(fù)載的藥物相比,核酸類藥物的LNP劑型還須促進(jìn)這些大分子進(jìn)入靶細(xì)胞的胞內(nèi)遞送。

圖6 LNP遞送RNA藥物機(jī)制(圖片來(lái)自于網(wǎng)絡(luò))

       藥物Onpattro的脂質(zhì)納米粒(LNP)由靜脈注射給藥后,載脂蛋白E(ApoE)吸附到LNP表面增強(qiáng)了LNP對(duì)于肝臟的非凡親和力(尤其是對(duì)肝細(xì)胞),與粒子相連的ApoE作為高效的靶向配體通過(guò)連接肝細(xì)胞表面的脂蛋白受體觸發(fā)通過(guò)內(nèi)吞作用攝取進(jìn)肝細(xì)胞。由于內(nèi)涵體pH值較低,可解離的脂質(zhì)發(fā)生質(zhì)子化,與帶負(fù)電荷的內(nèi)源性脂質(zhì)相互作用,導(dǎo)致核內(nèi)體膜的不穩(wěn)定,并向細(xì)胞質(zhì)釋放siRNA發(fā)揮藥理作用。

       GalNAc(N-乙酰半乳糖胺)偶聯(lián)修飾是當(dāng)前最常用的小核酸藥物遞送系統(tǒng)。將 N-乙酰化的半乳糖胺(GalNAc)以三價(jià)態(tài)的方式共價(jià)綴合到不同序列的 siRNA 的正義鏈 3′末端,形成多糖-siRNA 單綴合物,GalNAc 是唾液酸受體(ASGPR)的靶向性配體,其與肝臟表面細(xì)胞具有較高的親和力和迅速內(nèi)化能力。GalNAc 與肝細(xì)胞表面的 ASGPR 結(jié)合后進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)形成內(nèi)涵體,從而將足夠數(shù)量的 siRNA 帶入細(xì)胞內(nèi),從而實(shí)現(xiàn)向肝細(xì)胞的特異性遞送,并通過(guò)細(xì)胞內(nèi)吞作用使藥物進(jìn)入細(xì)胞發(fā)揮功能。

圖7 GalNAc-siRNA藥物遞送機(jī)制(圖片來(lái)自于網(wǎng)絡(luò))

        siRNA藥物研發(fā)中可應(yīng)用或嘗試的非病毒載體遞送系統(tǒng)除經(jīng)典陽(yáng)離子脂質(zhì)載體LNP外,還包括智能型陽(yáng)離子脂質(zhì)載體(環(huán)境敏感性、靶向修飾性等)、陽(yáng)離子聚合物(如天然殼聚糖(CS)及其衍生物等)、無(wú)機(jī)納米粒(如金納米粒(AuNPs)、氧化鐵納米粒、碳納米管(CNTs)和二氧化硅納米粒(SiNPs)等)、siRNA的綴合物載體(除GalNAc綴合物外,還包括細(xì)胞穿透肽(CPP)綴合物等)、仿生載體(外泌體(Ex)、RNA納米載體(RNPs)、紅細(xì)胞膜修飾的納米載體)等,遞送系統(tǒng)設(shè)計(jì)策略特別需要重點(diǎn)關(guān)注的是:具備組織和細(xì)胞靶向、內(nèi)體逃逸、安全性等功能,以及開發(fā)新型生物材料等,這對(duì)于siRNA藥物從實(shí)驗(yàn)室到臨床的轉(zhuǎn)化至關(guān)重要[3]。

  • 結(jié)語(yǔ)

       隨著寡核苷酸藥物的發(fā)展,其藥物研發(fā)流程亦逐漸完善,一般包括[4]:疾病發(fā)病機(jī)制研究,疾病相關(guān)靶向RNA的鑒定,RNA候選藥物的篩選?序列優(yōu)化?遞送系統(tǒng)設(shè)計(jì)與研究?藥理活性確認(rèn)、臨床前和臨床研究(藥代動(dòng)力學(xué)和毒理學(xué)安全性評(píng)價(jià))等?本文總結(jié)概述了已獲批寡核苷酸藥物的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、作用機(jī)制以及成藥性等方面的研究進(jìn)展,后續(xù)請(qǐng)繼續(xù)關(guān)注寡核苷酸藥物的臨床前研究(藥代動(dòng)力學(xué)(PK)、藥效學(xué)(PD)和安全性評(píng)價(jià))及生物樣品分析等相關(guān)內(nèi)容的總結(jié)。

匯智泰康是一家位于中美兩地的生物醫(yī)藥合同研發(fā)機(jī)構(gòu),整合中美兩地的藥物研發(fā)技術(shù)服務(wù)平臺(tái),基于AAALAC、GLP、ISO/IEC 17025實(shí)驗(yàn)室認(rèn)證,面向全球企業(yè)及研發(fā)機(jī)構(gòu)提供分析化學(xué)、藥代動(dòng)力學(xué)(DMPK)、藥理藥效、生物學(xué)、以及毒理安全性評(píng)價(jià)產(chǎn)品與服務(wù)。

  • 參考文獻(xiàn)

[1] 周宇,王士奇,孫濤等. 日本藥品和醫(yī)療器械管理局《寡核苷酸治療產(chǎn)品 非臨床安全性評(píng)價(jià)指導(dǎo)原則》指南介紹. 中國(guó)臨床藥理學(xué)雜志, 2022, 38(22): 2788-2792.

[2] E. Doxakis. Therapeutic antisense oligonucleotides for movement disorders[J]. Med Res Rev., 2020: 1–33.

[3] 陶鈺萍, 趙珍玉2, 李又欣等. siRNA 新型非病毒載體遞送策略新進(jìn)展[J]. 中國(guó)醫(yī)藥工業(yè)雜志, 2023, 54(4): 471-480.

[4] 王恒,李華,汪溪潔,等.小核酸藥物非臨床特點(diǎn)和藥理毒理評(píng)價(jià)策略[J].中國(guó)新藥雜志, 2022, 31(12): 9.